La Autonomía Universitaria posibilita que haya reglas protocolarias propias de cada universidad, las cuales están regidas por la normativa específica de cada uno de dichos entes.
En la UNAN-Managua, se dio el surgimiento de un equipo de protocolo integrado por estudiantes de las carreras que oferta el Departamento de Francés y coordinado por un docente del mismo, en la Facultad de Educación e Idiomas. Ante la importancia que representa el protocolo universitario para la consolidación de la imagen institucional, se creó la Oficina de Protocolo en la Dirección de Relaciones Públicas y Divulgación (posteriormente Dirección de Relaciones Públicas e Internacionales) y se consolida el equipo de protocolo de facultad, como Equipo de Protocolo UNAN-Managua, apoyando actividades oficiales de esta alma mater y otras instituciones u organizaciones.
A partir del año 2017, la UNAN-Managua es miembro de la Organización Internacional de Ceremonial y Protocolo (OICP), lo que le ha permitido la participación de un miembro del Rectorado y el Coordinador de la Oficina de Protocolo y Gestión de Viajes en los congresos que la OICP organiza.
De igual forma, por la dinámica de participación en eventos internacionales que tiene la comunidad universitaria de esta alma mater y ante la importancia de centralizar los trámites de viaje de esta, se suma a las funciones de la Oficina, la gestión y coordinación de las misiones institucionales que viajan al extranjero, canalizando los procesos y garantizando los recursos necesarios para cumplimiento de los compromisos que se han adquirido como UNAN-Managua.
::: Quehacer de la Coordinación de Protocolo y Gestión de Viajes :::
Organizar y brindar acompañamiento (antes, durante y después) a todas las actividades oficiales de la Institución.
Gestionar y coordinar las misiones institucionales en el extranjero, garantizando los recursos necesarios para el cumplimiento de los compromisos como UNAN-Managua.
Actividades internas
Atención a actividades oficiales de la Institución (antes, durante y después).
Apoyo en actividades de las facultades y centros de investigación.
Asistencia a eventos de instituciones u organizaciones, previa solicitud aprobada por el Rectorado.
Acompañamiento a delegaciones que realizan visita oficial a la UNAN-Managua.
Orientación sobre trámites migratorios y gestión de viajes.
Apoyo en talleres sobre relaciones humanas, etiqueta y protocolo, trabajo en equipo e imagen institucional.